为了获的强大的力量,有人与暴龙的基因融合;为了得到风一样的速度,有人与老鹰的基因融合,结果,他们的双臂就可以在他们的意识操纵下,变成两只肉翅,可以轻易飞上天空,还有许多其它基因改造出来的基因改造人。幽静的轻井泽,金田一一(松野太纪 配音)和七濑美雪(中川亚纪子 配音)与邀请他们的好友——经营电脑系统公司井泽研太郎(内山昂辉 配音)会面。井泽的老主顾火祀集团的青龙社长不久前死于列车事故,在他遇难之前,家中用于黑魔法的人偶消失,但事故当天一个断成两截的人偶突然出现, 与社长死状如出一辙。井泽怀疑这是一起S人事件,于是拜托金田一找出真正的凶手。在神秘的黑魔法公馆中,金田一一行见到了社长的养子晓(及川以造 配音)、九曜(宫野真守 配音)、星子(朴璐美 配音)以及黑魔法师黑瓜鬼门。人人都有嫌疑,人人都有不在场证明,而死亡事件仍在继续……